新研究室仍很简陋，但远比小阁楼宽大，路易斯很欢喜。而且，他有了一名年轻助手，名叫裘尔·罗兰，既健朗又聪明。裘尔·罗兰是高等师范学校的毕业生，他是第一个进入路易斯研究室当助手的人。
开始新研究的路易斯想：“如果微生物的孢子是飘浮在空气中，能否把它过滤取下来呢？”
他将试管的棉花塞子弄松，使空气能进到管内，结果棉花塞子附上了许多灰尘似的东西。路易斯将棉花塞取下，用显微镜仔细观察，发现除了有许多微细的泥沙以外，还有各种孢子。
“我们可下结论说，空气中必定有这样的孢子，这些孢子落入易腐溶液中，就会出芽繁殖，而使溶液腐败。”路易斯想完这些之后，将附有尘埃的小片棉花放进易腐溶液中实验，结果溶液腐败了。
经过一年的研究，他终于得到如下的结论：“空气中飘浮的东西，除了孢子，都不具有形成生命的条件。”这也就是说，即使用显微镜才能见到的微生物，也不是自然地发生，而是由飘浮在空气中的小小的孢子长成的。